医疗纠纷立案程序是：
1、当事人携带身份证及其复印件、起诉状和证据去法院起诉；
2、法院对案件材料进行审查，符合条件的予以受理，并且在7日内通知原告和被告；
3、法院受理之后，原告缴纳诉讼费，若不缴纳，法院会按撤诉处理。
法律依据:
《民事诉讼法》第一百二十二条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
第一百二十三条
起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。
