不能根据民事调解协议制作判决书，只能根据民事调解协议制作调解书。法律规定，调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书只有经双方当事人签收后，才会具有法律效力。
法律依据:
《《中华人民共和国行政强制法》》第九十七条
调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。
调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。
调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。
