医疗事故纠纷可以直接起诉。发生医疗事故后，当事人可以和医疗机构协商解决，也可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，还可以直接向人民法院提起诉讼。
法律依据:
《《医疗事故处理条例》》第四十条
当事人既向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，又向人民法院提起诉讼的，卫生行政部门不予受理；卫生行政部门已经受理的，应当终止处理。
《《医疗事故处理条例》》第四十六条
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
