起诉补偿决定或行政赔偿时，自行委托所作评估报告能被法院采信，但委托进行评估要经过法院准许，属于当事人举证的事项，评估机构要具有资质，评估报告要真实有效。
法律依据:
《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》第二十九条
原告或者第三人有证据或者有正当理由表明被告据以认定案件事实的鉴定结论可能有错误，在举证期限内书面申请重新鉴定的，人民法院应予准许。
《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》第三十条
当事人对人民法院委托的鉴定部门作出的鉴定结论有异议申请重新鉴定，提出证据证明存在下列情形之一的，人民法院应予准许：
（一）鉴定部门或者鉴定人不具有相应的鉴定资格的；
（二）鉴定程序严重违法的；
（三）鉴定结论明显依据不足的；
（四）经过质证不能作为证据使用的其他情形。
对有缺陷的鉴定结论，可以通过补充鉴定、重新质证或者补充质证等方式解决。
