行政赔偿案件适用调解。对于人民法院审理的行政案件，不适用调解，但行政赔偿、补偿以及行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件都是可以调解的。
法律依据:
《中华人民共和国行政诉讼法》第六十条
人民法院审理行政案件，不适用调解。但是，行政赔偿、补偿以及行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件可以调解。 调解应当遵循自愿、合法原则，不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。
《中华人民共和国行政诉讼法》第七十八条
被告不依法履行、未按照约定履行或者违法变更、解除本法第十二条第一款第十一项规定的协议的，人民法院判决被告承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等责任。 被告变更、解除本法第十二条第一款第十一项规定的协议合法，但未依法给予补偿的，人民法院判决给予补偿。
