发明专利被侵权的处理方式是：
1、请求专利管理机关调处。专利权人或者利害关系人可以请求侵权行为地区的专利机关或侵权单位的上级主管部门的专利管理机关处理；
2、向人民法院起诉。专利权人或者利害冲突人可以直接向人民法院起诉，也可以在专利管理机关作出处理后，对其不服再向人民法院起诉。
法律依据:
《《中华人民共和国专利法》》第六十条
国务院专利行政部门作出的给予实施强制许可的决定，应当及时通知专利权人，并予以登记和公告。
给予实施强制许可的决定，应当根据强制许可的理由规定实施的范围和时间。强制许可的理由消除并不再发生时，国务院专利行政部门应当根据专利权人的请求，经审查后作出终止实施强制许可的决定。
