民法典损坏他人财物5000以上的赔偿方式是以金钱赔偿为主，以财物的市价或者本身价值为参照标准。其次分清是否属于刑事案件，数额如果达到5千元或者是破坏次数在三次以上，则构成刑事案件，侵权人除了民事赔偿之外，还要承担民事责任。
法律依据:
《《中华人民共和国民法典》》第一千一百六十六条
【无过错责任原则】行为人造成他人民事权益损害，不论行为人有无过错，法律规定应当承担侵权责任的，依照其规定。
《《中华人民共和国民法典》》第一千一百六十七条
【危及他人人身、财产安全的责任承担方式】侵权行为危及他人人身、财产安全的，被侵权人有权请求侵权人承担停止侵害、排除妨碍、消除危险等侵权责任。
