医疗事故赔偿协议要想有效，必须满足两个条件：
一是协议必须是双方当事人真实意思体现；二是该协议不能违反相关法律法规。如果满足以上两个条件，那么该协议有效。
法律依据:
《《中华人民共和国民法典》》第一百四十八条
【以欺诈手段实施的民事法律行为的效力】一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
《《中华人民共和国民法典》》第一百四十三条
【民事法律行为有效的条件】具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
