医院被骗百亿，应该立即选择报警处理。对方的行为已经触犯了刑法，将会追究对方的刑事责任。同时医院内部对这一事件也应该痛定反思，吸取经验教训，对于相关处罚虚心接受，杜绝此类事件再次发生。
法律依据:
《《中华人民共和国刑法》》第二百六十六条
【诈骗罪】诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。本法另有规定的，依照规定。
