特大交通事故的调查程序：
（一）勘查事故现场，查明事故车辆、当事人、道路及其空间关系和事故发生时的天气情况； （二）固定、提取或者保全现场证据材料等；
（三）询问当事人、证人并制作询问笔录；现场不具备制作询问笔录条件的，可以通过录音、录像记录询问过程。
法律依据:
《道路交通事故处理程序规定》第二十九条
对发生一次死亡三人以上道路交通事故的，公安机关交通管理部门应当开展深度调查；对造成其他严重后果或者存在严重安全问题的道路交通事故，可以开展深度调查。具体程序另行规定。
第三十二条规定，交通警察应当对事故现场开展下列调查工作： （一）勘查事故现场，查明事故车辆、当事人、道路及其空间关系和事故发生时的天气情况； （二）固定、提取或者保全现场证据材料； （三）询问当事人、证人并制作询问笔录；现场不具备制作询问笔录条件的，可以通过录音、录像记录询问过程； （四）其他调查工作。
