市医疗保险和区医疗保险的区别：
1、所属单位不同。区级医保只能是本区直属单位的职工办理，而且档案由区人才代理中心保管。市级医保要市直属单位的职工才能办理，而且档案相应的在市人才代理中心。
2、地区不同。区级医保卡只可以在本区医保定点医院刷卡治疗，而市级医保卡可以在全市的医保定点医院刷卡治疗。
法律依据:
《社会保险法》第七条
国务院社会保险行政部门负责全国的社会保险管理工作，国务院其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。
县级以上地方人民政府社会保险行政部门负责本行政区域的社会保险管理工作，县级以上地方人民政府其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。
