员工突发疾病，如果属于工伤，由用人单位负责去申报，之后由单位和工伤保险基金依法支付赔偿；如果不属于工伤，有侵权责任人的，由该侵权人负责赔偿；如果无责任人，因自身原因造成的，则自行负责。
法律依据:
《《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》》第三条依法应当参加工伤保险统筹的用人单位的劳动者，因工伤事故遭受人身损害，劳动者或者其近亲属向人民法院起诉请求用人单位承担民事赔偿责任的，告知其按《工伤保险条例》的规定处理。
因用人单位以外的第三人侵权造成劳动者人身损害，赔偿权利人请求第三人承担民事赔偿责任的，人民法院应予支持。
《《中华人民共和国社会保险法》》第三十八条因工伤发生的下列费用，按照国家规定从工伤保险基金中支付：
（一）治疗工伤的医疗费用和康复费用；
（二）住院伙食补助费；
（三）到统筹地区以外就医的交通食宿费；
（九）劳动能力鉴定费。
