个税附加扣除的操作是：纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元。
法律依据:
《《个人所得税专项附加扣除暂行办法》》第五条纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。
《《个人所得税专项附加扣除暂行办法》》第十七条纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，可以按照以下标准定额扣除：
（一）直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元。
