选择个人所得税扣除年度的办法：对同一专项附加扣除的项目，只能选择一个年度，且在一个纳税年度内只能选择从一处取得的所得中减除；而对于除专项扣除、专项附加扣除等法定扣除以外的其他扣除，以居民个人一个纳税年度的应纳税所得额为限额；一个纳税年度扣除不完的，不结转以后年度扣除。
法律依据:
《《中华人民共和国个人所得税法实施条例》》第二十八条居民个人取得工资、薪金所得时，可以向扣缴义务人提供专项附加扣除有关信息，由扣缴义务人扣缴税款时减除专项附加扣除。纳税人同时从两处以上取得工资、薪金所得，并由扣缴义务人减除专项附加扣除的，对同一专项附加扣除项目，在一个纳税年度内只能选择从一处取得的所得中减除。
《《中华人民共和国个人所得税法实施条例》》第十三条专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除，以居民个人一个纳税年度的应纳税所得额为限额；一个纳税年度扣除不完的，不结转以后年度扣除。
