首先，同时履行抗辩权是从公平原则角度出发的制度设计，但债权人行使同时履行抗辩必须适当，禁止权利滥用。其次，建设工程施工合同是建设方和施工方合作完成工程的双务合同典范，双方权利义务具有特定性和相互制约性。同时履行抗辩权如被一方频繁运用，矛盾将不断上升和积累，导致工程施工难以为继。考虑建筑工程的上述信赖基础和相互配合依存关系，必须对同时履行抗辩进行限制。
关于瑕疵履行之情形。瑕疵仅轻微不符合时，不得援引同时履行抗辩。此外，建设施工合同普遍采取索赔时限制度，对于不在约定时限内提出相应索赔的，视为认可，也不得再行使同时履行抗辩。
关于迟延履行之情形。债务已届清偿期，债务人迟延履行的后果较为严重，对债权人造成较大损害时，才能援引同时履行抗辩权。此外，一方还须履行催告义务，经催告后合理期间内对方仍未履行的，如建设方未按期支付工程款，施工方一般可经催告后一至两个月停止施工。
同时履行的行使方式上，不允许采取默示方式，须以明示方式为之，履行通知义务。同时履行抗辩除非主张，它不自然产生效力。
债务人不履行义务须性质较为严重，债权人才可行使同时履行抗辩权。
