两者在客观上都侵犯了公共财物的所有权；两者在客观上均是利用职务之便；主观上两者都是出于直接故意。但是，作为两种不同犯罪形式，两者又有如下区别：
（1）主观方面不同。前者只是暂时使用，后者具备非法占有的故意，并没有打算归还。
（2）构成犯罪的时限要求不同。前者挪用公款数额较大归个人进行非营利性的合法使用的，必须非法控制公款超过三个月未还才构成犯罪；而贪污罪只要非法占有了公物即构成犯罪。
（3）在特定情况下的法律后果不同。如挪用公款未超过一万元归个人进行非营利性的合法使用时，超过三个月后在案发前全部归还本息的，可不认为犯罪；而贪污行为一经实施，即使在案发前全部退赃也不影响其犯罪的构成。
（4）刑程度不同。后者要比前者处罚重。
贪污罪与职务侵占罪的主要区别在于：
（1）犯罪主体不同。前者是国家工作人员；后者是公司或其他单位中除国家工作人员以外的其他工作人员。
（2）犯罪客体不同。前者侵犯的是国家工作人员公务行为的廉洁性和公共财产的所有权；后者侵犯提公司、企业或者其他单位的财产所有权。
（3）犯罪对象不同。前者只限于公共财产；后者是公司、企业或其他单位的财产，其中既公共财产，也包括私人财产。
（4）法定刑上有所不同。前者的最高法定刑为死刑；后者的最高法定刑却只有十五年有期徒刑。
