分公司可以独立开票。分公司是公司在其住所以外设立的以自己的名义从事活动的机构，不具有企业法人资格，其民事责任由总公司承担。
但在总公司规定的经营范围内，到所在地主管税务机关办理税务登记，接受税务管理，缴纳税款，开具发票。
经有权的税务机关批准汇总纳税的，按汇总纳税的规定缴纳税款开具发票。
【法律依据】
《中华人民共和国公司法》第十四条，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。
