商标被人擅自使用的处理方式是：
1、找对方协商。商标权利人可以先找侵权人协商，能够协商解决的就心平气和地解决。
2、收集证据。尽量收集足够的对方侵权的证据，如果商标是未经允许用到了某件产品上，那么这件产品可以作为证据之一拿来使用。
3、请求工商行政管理部门处理。在找相关部门处理的时候，既可以是商标侵权人所在地的工商行政管理部门，也可以是对方对商标侵权的行为地的工商行政管理部门。
4、向人民法院起诉。像找工商行政管理部门一样，商标侵权案件既可以实施商标侵权的行为地，也可以找商标侵权人所在地人民法院管辖。对此，被侵权人可以自主选择侵权行为地或侵权人所在地人民法院起诉。同时，由于商标侵权案件较为复杂，目前，最高人民法院指定中级人民法院管辖。
【法律依据】
《商标法》第六十条：工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处于二十五万元以下的罚款。对五年内实施两次以上商标侵权行为或者有其他严重情节的，应当从重处罚。
