聘用协议与劳动合同性质不一致，两者基本制度一致，但还有以下区别：劳动合同适用的主体为企业，聘用合同适用的范围主要为事业单位；事业单位尚不是完全意义上的独立的市场主体；企业已在改革中成为独立的市场主体；其他区别。
法律依据:
《中华人民共和国劳动合同法》第七条用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。
《中华人民共和国劳动合同法》第十条建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
