用人单位能否辞退拒绝打疫苗的员工，要看员工的工作是否属于感染风险较高的工种。分两种情况：
1.如果无理由辞退员工，肯定违法的。
2.如果员工是从事进口冷链、口岸检疫、航空空勤、公共交通等感染风险比较高的工作人员。员工无正当理由拒绝接种疫苗，很可能对单位的生产安全和经营安全带来隐患，则其行为构成严重违反公司规章制度，单位有权合法辞退。
【法律依据】
《劳动法》第二十五条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同。
1．在试用期间被证明不符合录用条件的；
2．严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的；
3．严重失职、营私舞弊，对用人单位利益造成重大损害的；
4．被依法追究刑事责任的。
