1、主体要件不同
抗税罪的主体要件是特殊主体、只有负有纳税义务或者代扣代缴、代收代缴税款义务的个人或单位的直接责任人员才可以构成；
妨害公务罪的主体要件是一般主体，凡达到刑事责任年龄且具有刑事责任能力的自然人都可以构成。
2、主观目的不同
抗税罪目的在于逃避缴纳税款而非法获利；
妨害公务罪目的在于使国家工作人员不能依法执行职务。
3、犯罪对象的范围不同
抗税罪侵害的对象是执行税收征管任务的税务人员；
而妨害公务罪侵害的对象则是执行职务的国家工作人员，范围更广。
4、侵犯的客体不同
抗税罪侵犯的是国家的税收管理制度；
妨害公务罪侵犯的是国家机关的公务活动。
【法律依据】
《刑法》第二百零二条，以暴力、威胁方法拒不缴纳税款的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处拒缴税款一倍以上五倍以下罚金;情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处拒缴税款一倍以上五倍以下罚金。
