商铺租赁期内房屋拍卖，如果房屋在出租后抵押的，拍卖时不影响房屋租赁合同的效力，但是如果抵押后再出租的，租赁合同对受让人不具有约束力。法院可以对租赁房屋进行拍卖，但不得侵犯承租人的权益。
【法律依据】
《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第十三条，对第三人为被执行人的利益占有的被执行人的财产，人民法院可以查封、扣押、冻结；该财产被指定给第三人继续保管的，第三人不得将其交付给被执行人。
对第三人为自己的利益依法占有的被执行人的财产，人民法院可以查封、扣押、冻结，第三人可以继续占有和使用该财产，但不得将其交付给被执行人。
第三人无偿借用被执行人的财产的，不受前款规定的限制。
