分公司可以独立核算，由公司自由决定。
独立核算是“非独立核算”的对称。就是对本单位的生产经营活动或预算执行过程及其结果进行全面的、系统的会计核算。
凡具有一定数额的资金，可对外办理结算，独立编制计划，单独计算盈亏的企业，一般都实行独立核算。
因此，分公司可以独立核算财务，所有收支单独记帐，单独在当地报税，总公司期末汇总分公司报表。
【法律依据】
《公司法》第十四条，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。
分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。
