在公司入保后死亡，保费应怎么处理需要区分具体情况：
1、如果该保险由公司作为投保人和受益人，保费由公司支付，那就是公司为避免事故与保险公司进行风险分摊的一种方式，因此保险利益的受益人应为公司。
2、如果保费由个人支付（或个人工资扣除），虽为公司统一办理，但投保人和受益人都是员工（或员工自行指定人员）；
那应该是员工对自身及家庭的风险保障，赔付应该归投保人指定的受益人，由其受益人进行继承。
【法律依据】
《保险法》第四十二条，被保险人死亡后，有下列情形之一的，保险金作为被保险人的遗产，由保险人依照《中华人民共和国继承法》的规定履行给付保险金的义务：
（一）没有指定受益人，或者受益人指定不明无法确定的；
（二）受益人先于被保险人死亡，没有其他受益人的；
（三）受益人依法丧失受益权或者放弃受益权，没有其他受益人的。
受益人与被保险人在同一事件中死亡，且不能确定死亡先后顺序的，推定受益人死亡在先。
