对方肇事逃逸保险的，交强险会进行赔偿，但是商业险不一定会赔偿，具体根据保险合同的约定确定。肇事逃逸并不属于交强险免赔的事由，所以交强险需要赔偿。但是如果肇事方未购买交强险的，则抢救费用等一系列费用由道路交通事故社会救助基金垫付。
【法律依据】
《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条，有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：
（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；
（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；
（三）被保险人故意制造道路交通事故的。
有前款所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。
