非全日制用工个人所得税的计算方式是，个人收入减除费用六万元、专项扣除、专项附加扣除、和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。适用税率为百分之三至百分之四十五的超额累进税。
法律依据:
《中华人民共和国个人所得税法》第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
《中华人民共和国个人所得税法》第三条个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；
《中华人民共和国个人所得税法》第六条应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
