1.地域管辖：
在股权转让协议纠纷中，如果双方当事人对管辖法院有约定且约定有效的，应适用其约定;没有约定或约定不明，应适用法律规定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。
2.级别管辖：原则上是由基层法院管辖；若属于重大涉外或者对本辖区有重大影响的，由中级人民法院管辖。
【法律依据】
1.《民事诉讼法》第十七条规定，基层人民法院管辖第一审民事案件，但本法另有规定的除外。
2.《民事诉讼法》第十八条规定，中级人民法院管辖下列第一审民事案件：
（一）重大涉外案件；
（二）在本辖区有重大影响的案件；
（三）最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件。
3.《民事诉讼法》第二十三条规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
