如果员工不配合办理离职手续，在劳动关系终止后，用人单位可以通过特快专递的形式向该员工的户籍所在地（或住所地）邮寄送达解除劳动合同通知书和社会保险转移表，也是会离职的。用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，如果用人单位违反劳动合同法的规定未向劳动者出具解除或者终止劳动合同的书面证明，由劳动行政部门责令改正;给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。
【法律依据】《劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
