三级医疗事故的医师的处罚，根据《医疗事故处理办法 》第二十一条 对造成医疗技术事故的直接责任人员，医疗单位应责令其作出书面检查，吸取教训，一般可免予行政处分;对情节严重的，也应当依照本办法第二十条的规定，酌情给予行政处分。
第二十条规定，对造成医疗责任事故的直接责任人员，医疗单位应当根据其事故等级、情节轻重、本人态度和一贯表现，分别给予三级医疗事故医生处罚以下行政处分：
一级医疗事故：记大过、降级、降职、撤职、开除留用察看、开除;
二级医疗事故：记过、记大过、降级、降职、撤职;
三级医疗事故：警告、记过、记大过、降级、降职。
