农民工资的保证金的缴纳比例是根据工程价款来决定的：
1、00万元以下的缴纳百分之五；100万到200万的缴纳百分之四；
2、00万到500万的缴纳百分之三；
5、00万以上的的缴纳百分之二；另外特殊的情况按特殊的缴纳。
法律依据:
《农民工工资保证金管理暂行办法》第十条
建筑施工单位按下列标准预存农民工工资保证金:
(一)工程合同价款在100 (不含100万)万元以下的，按工程合同价款的5%预存；工程合同价款在100万以上至200万元的(含100万元)，按工程合同价款的4%预存；工程合同价款在200万元至500 (含200万)万元的，按工程合同价款的3%预存；工程合同价款在500万元以上的(含500万)，按工程合同价款的2%预存；
(二)上年未完工的在建工程，建筑施工企业按剩余施施工量和相应比例补存工资保证金;
(三)包工不包料的工程按工程合同价款的8%预存。
