食品流通许可证不注销会有影响。食品经营许可证不注销，会产生不注销的费用。根据相关法律规定，食品经营者终止食品经营，食品经营许可被撤回、撤销或者食品经营许可证被吊销的，应当在30个工作日内向原发证的食品药品监督管理部门申请办理注销手续。
法律依据:
《食品经营许可管理办法》第三十八条食品经营许可证变更、延续、补办与注销的有关程序参照本办法第二章和第三章的有关规定执行。
《食品经营许可管理办法》第三十六条食品经营者终止食品经营，食品经营许可被撤回、撤销或者食品经营许可证被吊销的，应当在30个工作日内向原发证的食品药品监督管理部门申请办理注销手续。食品经营者申请注销食品经营许可的，应当向原发证的食品药品监督管理部门提交下列材料：
（一）食品经营许可注销申请书；
（二）食品经营许可证正本、副本；
（三）与注销食品经营许可有关的其他材料。
