用人单位负有举证责任，主要基于以下考虑：
1、负伤职工与用人单位相比处于弱势地位，保护劳动者的合法权益是劳动法和社会保险法律法规的最基本的原则；
2、用人单位有可能为逃避事故责任，而采取转移现场，撕毁、销毁相关文件材料等手段，使证据灭失。
法律依据:
《工伤保险条例》第19条第2款的规定，职工或其直系亲属认为是工伤，而用人单位认为不是工伤的，由用人单位承担举证责任。这里的举证责任是指在工伤认定中，用人单位与工伤职工或者亲属，对职工受到事故伤害是否为工伤发生争议，用人单位对认为不是工伤的事实有提供证据加以证明的责任。如果用人单位不能出示足够的证据证明职工受到的伤害不是工伤，那么，用人单位的诉求就得不到法律支持。
