第一、商住两用房一般会按照商业用水、用电的价格来计算水电费用，会比普通住宅的水电费略高。
第二、商住两用楼存在安全及消防隐患。
第三、商住两用房只能全款或用商业贷款，不可使用公积金贷款和组合贷款。
第四、商住两用的房屋产权是40年，至于产权到期之后房子如何处理，《物权法》并没有做出相应规定。
第五、商住两用房在进行二次交易时，税费要比一般商品房高。
【法律依据】
《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第六条 当事人以商品房预售合同未按照法律、行政法规规定办理登记备案手续为由，请求确认合同无效的，不予支持。
当事人约定以办理登记备案手续为商品房预售合同生效条件的，从其约定，但当事人一方已经履行主要义务，对方接受的除外。
