行政单位租赁收入应按5%缴纳营业税，是否应交房土税要分情况：
1、出租方为房土税免税单位，承租方为纳税单位，由出租方按租金缴纳房土税；
2、出租方和承租方均为房土税免税单位，不交房土税；
3、出租方为房土税纳税单位，由出租方按房产原值缴纳房土税行政事业单位若有财政拨款，即为房土税免税单位。
法律依据:
《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第九条
企业应纳税所得额的计算，以权责发生制为原则，属于当期的收入和费用，不论款项是否收付，均作为当期的收入和费用；不属于当期的收入和费用，即使款项已经在当期收付，均不作为当期的收入和费用。本条例和国务院财政、税务主管部门另有规定的除外。
