特殊病种到期续签流程如下：
1、先要去档案室调取病历资料；
2、到医保科去拿特殊病种申请表；
3、再叫主治医生填写，盖章，交到医保科审核；
4、医院办理完结后，患者或家属携带相关到户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表，审批表到当地社保局审批并盖章。
法律依据:
《中华人民共和国社会保险法》第二十九条参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
