劳动关系中的赔偿金要交税，交税金额根据上年度职工的平均工资判断。上年度职工平均在工资三倍以内的，免税，超过部分按相应规定交税，保险赔偿除外。
赔偿金是指用人单位或者职工因违反法律规定或者违反合同约定，造成对方经济损失而向对方支付的赔偿，赔偿金具有惩罚性，是一种惩罚性赔偿。用人单位“违法”是职工请求赔偿金的前提，职工发现用人单位违法解除或终止劳动合同的，有权请求其支付赔偿金。
职工所获得的赔偿金应当按规定计入其综合所得中，用该年度的应纳税所得额适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率，即为职工在该项收入中所要缴纳的个税。
法律依据:
《个人所得税法》第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
第四条
下列各项个人所得，免征个人所得税：
（一）省级人民政府、国务院部委和中国人民解放军军以上单位，以及外国组织、国际组织颁发的科学、教育、技术、文化、卫生、体育、环境保护等方面的奖金；
（二）国债和国家发行的金融债券利息；
（三）按照国家统一规定发给的补贴、津贴；
（四）福利费、抚恤金、救济金；
（五）保险赔款；
（六）军人的转业费、复员费、退役金；
（七）按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、基本养老金或者退休费、离休费、离休生活补助费；
（八）依照有关法律规定应予免税的各国驻华使馆、领事馆的外交代表、领事官员和其他人员的所得；
（九）中国政府参加的国际公约、签订的协议中规定免税的所得。
