企业注册时上传主体资格相关材料的方式是按照提示，准备好营业执照或者工商基本信息、组织机构代码证、营业执照、单位代码、银行开户、税务等方面的证明文件，依次上传即可。
法律依据:
《中华人民共和国公司法》第六条设立公司，应当依法向公司登记机关申请设立登记。符合本法规定的设立条件的，由公司登记机关分别登记为有限责任公司或者股份有限公司；不符合本法规定的设立条件的，不得登记为有限责任公司或者股份有限公司。
法律、行政法规规定设立公司必须报经批准的，应当在公司登记前依法办理批准手续。
公众可以向公司登记机关申请查询公司登记事项，公司登记机关应当提供查询服务。
