许可经营项目登记无效的情形有：
1、从事法律、行政法规、国务院决定禁止企业经营的项目的；
2、属于许可经营项目，但是没有提交审批或者是不能提交审批机关的批准文件、证件的；
3、注册资本未达到法律、行政法规规定的从事该项目经营的最低注册资本数额的等。
法律依据:
《中华人民共和国行政许可法》第二条本法所称行政许可，是指行政机关根据公民、法人或者其他组织的申请，经依法审查，准予其从事特定活动的行为。
《中华人民共和国行政许可法》第四条设定和实施行政许可，应当依照法定的权限、范围、条件和程序。
《中华人民共和国行政许可法》第五条设定和实施行政许可，应当遵循公开、公平、公正、非歧视的原则。
