企业一直零申报的会被税务机关罚款，严重的还会被稽查。首先税务机关会把纳税人纳入重点的监控范围内，然后进行相关的纳税评估，如果被评估发现隐瞒收入，虚开发票等行为的，则就要补缴税款和滞纳金。
法律依据:
《中华人民共和国税收征收管理法》第一条为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
《中华人民共和国税收征收管理法》第二条凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
《中华人民共和国税收征收管理法》第三条税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
