保证保险合同与保证保险合作协议之间可以是包含关系。如果投保人与保险人约定将保证保险合作协议作为保险合同的部分内容的，应将保证保险合作协议视为保证保险合同的特别约定。当保证保险合同与作为其特别约定的保证保险合作协议内容有冲突时，除另有约定外，以保证保险合作协议约定为准。
法律依据:
《保险法》第十条保险合同是投保人与保险人约定保险权利义务关系的协议。
投保人是指与保险人订立保险合同，并按照合同约定负有支付保险费义务的人。
保险人是指与投保人订立保险合同，并按照合同约定承担赔偿或者给付保险金责任的保险公司。
