税务局可以代公司开发票。公司或者自然人需要临时使用发票的，可以凭购销商品的书面证明、经办人身份证明，向经营地税务机关申请代开增值税普通发票，但是不能申请代开增值税专用发票。
法律依据:
《中华人民共和国发票管理办法》第十九条销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票；特殊情况下，由付款方向收款方开具发票。
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二十条税务机关应当与受托代开发票的单位签订协议，明确代开发票的种类、对象、内容和相关责任等内容。
