申请发行公司债券应提交文件包括：
（1）公司登记证明，即由主管登记机关核发的《中华人民共和国企业法人营业执照》；
（2）公司章程；
（3）资产评估报告和验资报告，证明公司资本情况的真实性。
法律依据:
《中华人民共和国证券法》第十六条申请公开发行公司债券，应当向国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构报送下列文件：
（一）公司营业执照；
（二）公司章程；
（三）公司债券募集办法；
（四）国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构规定的其他文件。
依照本法规定聘请保荐人的，还应当报送保荐人出具的发行保荐书。
