合同纠纷的处理方式在合同中的书写：
1、双方当事人可以直接写明，一方当事人未按照约定履行合同的，一方当事人应当承担何种违约责任，也可以约定违约金；
2、双方当事人还可以约定发生纠纷后，是选择诉讼解决还是申请仲裁，可以由双方当事人达成约定，然后写在合同中。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
（一）当事人的姓名或者名称和住所；
（二）标的；
（三）数量；
（四）质量；
（五）价款或者报酬；
（六）履行期限、地点和方式；
（七）违约责任；
（八）解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。
